工廠化循環水養殖系統的典型工藝和裝備是以物理過濾結合生物過濾為主體，對養殖水體進行深度凈化，并集成了水質自動監控系統，實時監測并調控養殖水體質量并可追溯。該系統具有工藝技術完善、水處理效果好、水質狀況穩定、生產操作舒適、設備維護簡便、運行成本低、系統投資省等優點。這是一套簡潔有效的工藝技術路線：魚池出水自流進入微濾機池，去除殘餌和魚糞等顆粒直徑大于60微米的固體懸浮物質，經水泵提升進入生物濾器，一方面截流微小的顆粒懸浮物，另一方面對水體中的氨氮進行降解，凈化后的水自流回魚池。
工廠化循環水從水處理的側重點不同分為機械模式和生化模式，主要區別就是看能耗大小，本文所講的是生化模式。這個模式能否成功，與虹吸能否順利運行有直接關系，虹吸設備需要時常維護否則會莫名其妙的失效。有人說：我都準備投入了30萬，你告我天天還得維護，這是搞毛線啊？虹吸失敗的話，整個系統視養殖密度在兩天到四天以內崩潰----魚蝦死光光。工廠化循環水系統的重點是凈水系統，占比50%；生物習性占30%；其他的溶氧恒溫等條件的占比20%。
養殖水質量好的會減少細菌的滋生，從而減少疾病的發生，養殖水質量差的容易滋生細菌和寄生蟲，從而導致疾病爆發。維持水體環境平衡何其艱難，天氣的突變、人為操作不當、機器故障等因素都會破壞水體的環境，導致養殖水質量變差，從而引發一系列問題。廣州環控農業生物科技有限公司就如何維持水體環境、提高養殖水質量方面花了大量的時間去研發，為了能夠更有效、更科學、更環保去進行水產養殖。目前已取得不錯成效，很多客戶采用了廣州環控研發的循環水養殖設備、循環水養殖系統、生物絮團養殖系統、集裝箱養魚設備后，養殖產品不僅質量提高了，產量也提高了，養殖周期縮短了。