生化模式凈水主要是靠硝化細菌，硝化細菌從無到有這個過程俗稱掛膜。硝化細菌掛膜需要濾材（細菌屋）；硝化細菌屬于好氧細菌，因此需要氧氣；硝化細菌繁殖還需要養分，也就是魚糞。再滿足上訴三個情況下，保持25度水溫，硝化細菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個過程叫冷啟動。想快速啟動，可以使用液體硝化細菌，或者添加一些其他已經掛膜的濾材進來進行引菌，這個過程叫熱啟動。海水系統應為高鹽度的問題，自然掛膜時間比淡水系統要長一倍以上，時間也隨鹽度升高而延長。
這套系統叫做循環水養殖系統，也可以形象地理解為“工廠化養殖”，是目前先進的水產生態養殖技術。在總產不降的情況下，從原有的養殖水面辟出一塊進行集約化，解決了水源問題，使養殖水質比較穩定，對周邊環境也比較友好。可增產增效、節地節水，破解了常規養殖面臨的諸多可持續發展問題。工廠化循環水養殖是一種現代工業化生產方式，基本上不受自然條件的限制，可以根據需要在任何地點建立海水或淡水的養殖生產系統，達到生產過程程序化、機械化的要求。
工廠化循環水養殖系統不僅節能節水效果較好，而且還對防止養殖病害發生、實現養殖過程零用藥、提高產品質量和經濟效益發揮重要的作用。