循環水養殖系統難點是解決氮循環的問題，要消除氨氮和亞硝/酸氮的影響。傳統的解決方案是在循環水養殖系統中加入了反硝化反應池，但由于反硝化作用需要在嚴格厭氧條件下進行，因此硝化作用反應池需要跟反硝化作用反應池分開，這就增加了循環水養殖系統的成本。前循環水養殖設備已實現工廠化生產，實現養殖池與養殖凈化設備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環水養殖系統中，實現養殖水的循環利用。
當滾筒內懸浮物積聚到一定數量時，會引起濾網透水量下降，導致滾筒內水位上升，當水位上升到設定的高水位時：液位自動控制系統工作，此時，反清洗水泵和滾筒電機同時自動開啟，反清洗水泵的高壓水經微濾機的反清洗系統對旋轉的滾筒濾網進行高壓清洗，堵塞在滾筒濾網上的懸浮物在高壓水的沖洗下，流入污物收集槽再經排污管排出。做工廠化循環水養殖，選擇好循環水養殖水處理系統關鍵。依靠專業的技術能力，在節約系統占地面積的同時，率先做到了低能耗，整個循環水養殖水處理系統只在水泵和消毒設備上使用到電能，其余均實現了水力自動化，相比較目前市場上的水處理系統，在能耗上大幅降低，成為了養殖用戶的重要選擇。
廣州環控農業生物科技有限公司針對改底這一種現象進行了大量的研究和試驗，發現流動的水體有助于池底的改善，再配合科學的喂養方式以及定期的池底清潔，能夠很好改善底部質量，從而改善水體質量。這種科學的養殖系統稱為循環水養殖系統，循環水養殖系統由多種循環水養殖設備構成，這一整套循環水養殖設備就是改善養殖水體質量的主要工具，適用于各種水產品種養殖。