二代測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域有哪些? 基因組學(xué)研究:用于全基因組測(cè)序,快速獲取物種的基因組序列信息,研究基因組結(jié)構(gòu)、變異、進(jìn)化等;進(jìn)行全外顯子組測(cè)序,重點(diǎn)關(guān)注編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域,發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的基因突變。 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序,可分析基...
二代測(cè)序的建庫(kù)步驟⑤ 五、文庫(kù)富集(可選步驟) PCR富集:對(duì)于一些起始樣本量較少或者連接效率較低的情況,可能需要進(jìn)行PCR富集。利用與接頭序列互補(bǔ)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,增加文庫(kù)中目標(biāo)DNA片段的數(shù)量。在PCR反應(yīng)中,需要注意引物的設(shè)計(jì)要與接頭...
不同二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)的速度 Illumina 測(cè)序平臺(tái):這是目前市場(chǎng)上應(yīng)用較為***的二代測(cè)序平臺(tái)之一,其測(cè)序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列,一次運(yùn)行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),通量可達(dá)數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長(zhǎng),能夠滿足大...
不同二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)的速度 Illumina 測(cè)序平臺(tái):這是目前市場(chǎng)上應(yīng)用較為***的二代測(cè)序平臺(tái)之一,其測(cè)序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列,一次運(yùn)行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),通量可達(dá)數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長(zhǎng),能夠滿足大...
二代測(cè)序——數(shù)據(jù)分析類問(wèn)題 二代測(cè)序數(shù)據(jù)分析的主要內(nèi)容和挑戰(zhàn)是什么:主要內(nèi)容包括數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制、序列比對(duì)、變異檢測(cè)、基因表達(dá)定量、功能注釋等。挑戰(zhàn)在于數(shù)據(jù)量巨大,需要高效的計(jì)算資源和復(fù)雜的生物信息學(xué)算法來(lái)處理;數(shù)據(jù)質(zhì)量參差不齊,需要嚴(yán)格的質(zhì)量控制和過(guò)...
二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)分別有哪些? 優(yōu)勢(shì):能夠同時(shí)得到大量的序列數(shù)據(jù),相比于一代測(cè)序技術(shù),通量提高了成千上萬(wàn)倍;單條序列成本非常低廉。 劣勢(shì):序列讀長(zhǎng)較短,Illumina平臺(tái)為250-300bp,454平臺(tái)也只有500bp左右;由于建庫(kù)中利用了...