循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)難點是解決氮循環(huán)的問題，要消除氨氮和亞硝/酸氮的影響。傳統(tǒng)的解決方案是在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中加入了反硝化反應池，但由于反硝化作用需要在嚴格厭氧條件下進行，因此硝化作用反應池需要跟反硝化作用反應池分開，這就增加了循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的成本。前循環(huán)水養(yǎng)殖設備已實現(xiàn)工廠化生產(chǎn)，實現(xiàn)養(yǎng)殖池與養(yǎng)殖凈化設備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，實現(xiàn)養(yǎng)殖水的循環(huán)利用。
未來社會工業(yè)化的發(fā)展趨勢以及世界先進養(yǎng)殖模式的發(fā)展水平預示，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)將是未來水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要模式。因此，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖是我國水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要發(fā)展方向。國際上沒有工廠化養(yǎng)殖這一提法，與工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)相對應的是循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)（RAS），其主要特征是水體循環(huán)利用，日均水利用率在95%以上，如低于此指標，即為流水養(yǎng)殖。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖與傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式相比，具有節(jié)水、節(jié)地、高密度集約化和排放可控的特點，符合可持續(xù)發(fā)展要求，是未來水產(chǎn)養(yǎng)殖方式轉(zhuǎn)變的必然趨勢。
保持水深在40～80厘米。氨氮含量小于每升0.2毫克，溶氧大于每升5毫克，保持水質(zhì)清新。光照強度500～2000勒克斯，光照均勻。根據(jù)要求調(diào)節(jié)水溫和換水量。養(yǎng)殖過程需按時測定水溫、pH值、溶解氧、鹽度、COD、氨氮、亞硝(xiao)酸鹽、硝(xiao)酸鹽、磷酸鹽等相關指標，將各項指標控制在合適的范圍內(nèi)。當水溫高于20℃時，需要加大地下低溫海水的添加量和循環(huán)水量，并采取加大純氧供給量的措施，使氧氣飽和度達到100～150%（有液氧設施）。由于夜晚時間比較長，也是魚類生長速度比較快的時段，因此每天傍晚要堅持清潔養(yǎng)殖池一次，并進行一次池底排污操作，給魚苗創(chuàng)造一個良好生長的環(huán)境。