工廠化循環水養殖系統不僅節能節水效果較好，而且還對防止養殖病害發生、實現養殖過程零用藥、提高產品質量和經濟效益發揮重要的作用。
20世紀90年代，在淡水養殖方面，隨著經濟的快速發展，全國各地興建了很多水產養殖示范區，建立了一批淡水魚類工廠化循環水養殖系統，但是其經濟性矛盾依然突出。而工廠化循環水苗種繁殖生產系統具有水環境可控、苗種質量高等優點，適應了苗種生產的反季節性、水質條件要求高的特點，并且苗種的單位產值高，使之得到了一定程度的應用。以大菱鲆工廠化流水養殖為代表的海水工廠化養殖的大力推廣，隨之而來的是優質水資源大量耗用，尤其是地下水資源，造成地下水位下降、地陷等諸多問題?！熬盼濉币詠?，國家有關科研計劃大力支持海水工廠化循環水養殖的研究，并取得了重要的階段性成果。
保持水深在40～80厘米。氨氮含量小于每升0.2毫克，溶氧大于每升5毫克，保持水質清新。光照強度500～2000勒克斯，光照均勻。根據要求調節水溫和換水量。養殖過程需按時測定水溫、pH值、溶解氧、鹽度、COD、氨氮、亞硝/酸鹽、硝/酸鹽、磷S鹽等相關指標，將各項指標控制在合適的范圍內。當水溫高于20℃時，需要加大地下低溫海水的添加量和循環水量，并采取加大純氧供給量的措施，使氧氣飽和度達到100～150%（有液氧設施）。由于夜晚時間比較長，也是魚類生長速度比較快的時段，因此每天傍晚要堅持清潔養殖池一次，并進行一次池底排污操作，給魚苗創造一個良好生長的環境。