我國工廠養殖目前受水處理成本的壓力，仍主要以流水養殖、半封閉循環水養殖為主，真正意義上的全封閉循環水養殖企業較少。流水養殖和半封閉養殖方式產量低（單位水體產量10—15千克/米2·年）、耗能大、效率低，與先進國家技術密集型的循環水養殖系統相比，在系統的循環水率、系統輔助水體的比率等關鍵性能方面基本接近國際水平，在設備、工藝、產量（先進技術的產量達100千克/米2·年以上）和效益等方面，以及生物凈化系統的構建、凈化效率和穩定性、系統集成度、系統穩定性等方面仍存在著一定的差距。
工廠化循環水養殖的實質是養殖生產的工業化，生產過程可控，可以跨季節養殖，產品像工業品一樣可以有計劃地均衡上市。其特點：一是用水量少，可利用較低質水源，對水資源要求較低；二是占地少，對土地資源的要求低；三是養殖密度高，單位耗水產量大；四是易于控制生長環境，魚類(以及其他養殖種類)生長速度快，生長周期短；五是飼料利用率高；六是水循環使用，利用系數高；七是排放的廢水廢物少，能集中處理，對環境無壓力或很小；八是不受外界氣候的影響，可實現常年生產。
在目前的發展水平下，循環水養殖模式較高的準入門檻使得循環水養殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養殖品種有限，限制了循環水養殖模式的發展。近些年來，經過專家學者和眾多的養殖企業的不斷探索，國內循環水養殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環水養殖系統既是一個復雜的系統工程，又是一個矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養殖品種的循環水養殖系統，只要不出現明顯的設計漏洞，系統運行過程中遇到的很多問題，可以通過系統管理技術和養殖技術來解決。