聚合酶鏈反應的常見問題分析與解決方法:無擴增條帶:酶失活或在反應體系中未加入酶。Taq DNA聚合酶因保存或運輸不當而失活,往往通過更換新酶或用另一來源的酶以獲得滿意的結果。模板含有雜質。特別是對甲醛固定及石蠟包埋的組織常含甲酸,造成DNA脫嘌呤而影響PCR的結果。變性溫度是否準確:PCR儀指示溫度與實際溫度是否相符,過高酶在前幾個循環就迅速失活;過低則模板變性不徹底。反應系統中污染了蛋白酶及核酸酶,應在未加Taq酶以前,將反應體系95℃加熱5-10 min。引物變質失效。人工合成的引物是否正確。是否純化,或因儲存條件不當而失活。引物錯誤。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。 DNA凝膠電泳時加入陽性對照,確保不是DNA凝膠和PCR程序的問題。熱啟動聚合酶鏈式反應可以通過將反應組分加熱到變性溫度在加入聚合酶之前。溫州血液RT-PCR檢測技術原理及步驟
聚合酶鏈反應的常見問題分析與解決方法:PCR產物量過少:退火溫度不合適。以2度為梯度設計梯度PCR反應優化退火溫度。DNA模板量太少。增加DNA模板量。PCR循環數不足。增加反應循環數。引物量不足。增加體系中引物含量。延伸時間太短。以1 kb/min的原則設置延伸時間。變性時間過長。變性時間過長會導致DNA聚合酶失活。DNA模板中存在抑制劑。確保DNA模板干凈。擴增產物在凝膠中涂布或成片狀條帶彌散:酶量過高。減少酶量;酶的質量差,調換另一來源的酶。dNTP濃度過高。減少dNTP的濃度。南通微量熒光PCR研究方案PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構成。
逆轉錄-聚合酶鏈反應的原理是:提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。完整RNA 的提取和純化,是進行RNA 方面的研究工作,如Nothern雜交、mRNA 分離、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及體外翻譯等的前提。所有RNA的提取過程中都有五個關鍵點,即樣品細胞或組織的有效破碎;有效地使白復合體變性;對內源RNA酶的有效抑制;有效地將RNA從DNA和蛋白混合物中分離;對于多糖含量高的樣品還牽涉到多糖雜質的有效除去。但其中很關鍵的是抑制RNA酶活性。RNA 的提取目前階段主要可采用兩種途徑,提取總核酸,再用氯化鋰將RNA 沉淀出來;直接在酸性條件下抽提,酸性下DNA與蛋白質進入有機相而RNA 留在水相。種提取方法將導致小分子量RNA 的丟失,目前該方法的使用頻率已很低。
聚合酶鏈式反應準備:PCR引物設計:PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。引物設計的基本原則:引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現非特異條帶。ATGC很好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。聚合酶鏈反應可以選擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質功能。
聚合酶鏈式反應的步驟:標準的PCR過程分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA;退火:(60℃-65℃):系統溫度降低,引物與DNA模板結合,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性很好)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的DNA鏈。每一循環經過變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。現在有些PCR因為擴增區很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內復制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行。流聚合酶鏈反應將溶液置于熱梯度下,而不是反復加熱和冷卻聚合酶鏈反應混合物。杭州骨頭PCR檢測技術應用
聚合酶鏈式反應PCR技術的基本原理類似于DNA的天然復制過程。溫州血液RT-PCR檢測技術原理及步驟
聚合酶鏈式反應是一種在體外快速擴增特定基因或DNA序列的方法,故又稱為基因的體外擴增法。PCR技術類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR能快速特異擴增任何已知目的基因或DN段,并能輕易在皮克(pg)水平起始DNA混合物中的目的基因擴增達到納克、微克、毫克級的特異性DN段。因此,PCR技術一經問世就被迅速而較廣地用于分子生物學的各個領域。 異常結果: 各種疾病所致的異常,例如梅毒。一期梅毒。即硬下疳 ,潛伏期2-4周,外生殖器部位發生暗紅色硬腫塊 、淺潰瘍 ,有軟骨樣硬度,周圍淋巴結腫大。二期梅毒。在一期梅毒 1-2 個月之后,全身皮膚、粘膜發生對稱泛發皮疹、斑疹、、疹等。粘膜可發生粘膜斑、扁平濕疣,傳染性強。三期梅毒。發生在染上后2-3年乃至10年,皮膚為樹膠樣腫,還可涉及骨、關節、心、血管,表現為主動脈炎、主動脈瓣閉鎖不全和主動脈瘤等,侵及神經為脊髓癆 ,全身麻痹 ( 麻痹性癡呆 )等等。 需要檢查的人群:疑似某種特定的疾病病人,進行分子特異性檢查。溫州血液RT-PCR檢測技術原理及步驟