聚合酶鏈式反應(PCR)是一種用于放大擴增特定的DN段的分子生物學技術,它可看作是生物體外的特殊DNA復制,PCR的很大特點是能將微量的DNA大幅增加。因此,無論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前兇殺案中兇手所遺留的毛發、皮膚或血液,只要能分離出一丁點的DNA,就能用PCR加以放大,進行比對。這也是“微量證據”的威力之所在。發明了聚合酶鏈反應,即簡易DNA擴增法,意味著PCR技術的真正誕生。到2013年,PCR已發展到第三代技術。聚合酶鏈反應的這種能力增強了許多方法,例如生成雜交探針用于雜交。武漢骨頭Real-time PCR技術服務
Real-time PCR相對定量中的標準曲線法如何進行:主要是相對定量標準品的制作,一般有三種方法:1、比較復雜的方法:質粒,采用Biotnt提供內參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對目的基因進行Real-time PCR實驗,得到PCR擴增產物;PCR擴增產物轉入質粒中,得到相對定量的標準品;2、一般采用的方法1:比較強的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR擴增產物,如果在方法2中找不到比較強的CDNA模板,則選用PCR產物作為相對定量的標準品也是可以的;需要注意的事項是:PCR產物濃度很高,而Real-time PCR的產物片段比較短,容易在稀釋的過程中造成PCR污染,要注意操作。南通細胞定量PCR在不同的PCR反應管中加入已定量的內標和引物,內標用基因工程方法合成。
引物的設計注意事項:1,引物設計要跨內含子,不能在一個外顯子上(我們的實驗是以cDNA為模板來擴增的,如果有DNA污染的話,因為DNA上含有分子量很大的內含子,不可能完成擴增。這對我們消除整個實驗的誤差起很大的作用)。2,引物設計的時候要盡可能設計在同一退火溫度,方便于以后同時擴增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大,就得分開做,浪費模板,浪費管家基因,所以每個實驗室設計引物的時候要盡可能一致,這樣就不用每次查退火溫度,且對整個實驗有利。
Real-time PCR鏈式反應的常見問題:靶序列變異:如靶序列發生突變或缺失,影響引物與模板特異性結合,或因靶序列某段缺失使引物與模板失去互補序列,其PCR擴增是不會成功的。假陽性:出現的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現假陽性。需重新設計引物。出現片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環次數過多引起。其對策有:減少酶量,或調換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃度。增加模板量,減少循環次數。聚合酶鏈式反應準備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。Real-time PCR反是一項利用DNA雙鏈復制的原理。
Real-time PCR原理:所謂實時熒光定量PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。DNA結合染料法,應用一種帶有熒光的、非特異的DNA結合染料檢測PCR過程中積累的擴增產物。檢測所有雙鏈DNA擴增產物,包括非特異反應產物,如引物二聚體。可對任何雙鏈DNA進行定量;不需要探針,因此減少了實驗設計及運轉成本;適合于大量基因的分析;簡單易用。實時熒光定量PCR:實時熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質測每次聚合酶鏈式反應(PCR)循環后產物總量的方法。通過內參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴增過程中,通過熒光信號,對PCR進程進行實時檢測。由于在PCR擴增的指數時期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數存在線性關系,所以成為定量的依據。聚合酶鏈反應允許快速生產短DN段,即使已知的引物序列不超過兩個。南通細胞定量PCR
實時定量PCR通用電腦,自動分析軟件等構成。武漢骨頭Real-time PCR技術服務
Real-time PCR式反應準備:10×擴增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、TaqDNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據實驗調整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應五要素:參加PCR反應的物質主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細胞內DNA復制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。武漢骨頭Real-time PCR技術服務
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