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在體光纖成像記錄相干斷層掃描的局限性是單能掃描生物組織表面下1-2毫米的深度。這是由于深度越大，光線無散射的射出表面的比例就越小，以至于無法檢測到。但是在檢測過程中不需要樣品制備過程，成像過程也不需要接觸被成像的組織。更重要的是，設備產生的激光是對人眼安全的近紅外線，因此幾乎不會對組織造成傷害。使用光學反向散射或后向反射的測量成像組織的內部橫截面微結構，像在體外在人的視網膜上，并在一個其他的病因斑塊在透明，弱散射介質和不透明的。在體光纖成像記錄待成像物體所處環境為血管，支氣管。南京神經元成像光纖網站

小動物在體光纖成像記錄圖像處理軟件除了提供含有光子強度標尺的成像圖片外，還能計算分析發光面積、總光子數、光子強度的相關參數供實驗者參考。原則上，如預實驗時拍攝出圖片非特異性雜點多，需降低曝光時間；反之，如信號過弱可適當延長曝光時間。但曝光時間的延長，不單增加了目的信號，對于背景噪音也存在一個放大效應。同一批實驗應保持一致的曝光時間，同時還應保持標本相對位置和形態的一致，從而減少實驗誤差。進行熒光成像時，實驗者可選擇背景熒光低不容易反光的黑紙放在動物標本身下，減少金屬載物臺的反射干擾。深圳鈣熒光指示蛋白病毒光纖成像記錄技術在體光纖成像記錄需要許多數據點。

根據在體光纖成像記錄成像方式的不同, 在體生物發光成像主要有生物發光成像,和生物發光斷層成像兩種。其中,輸出是二維圖像, 即生物體外探測器上采集的光學信號，其原理簡單、 使用方便快捷, 適用于 定性分析及簡單的定量計算, 但無法獲得生物體內發光光源的深度信息, 難以實現光源的準確定位。 而成像系統則利用 多個生物體外探測器上采集的光學信號, 根據斷層成像的原理, 采用特定的 反演算法 ，得到活的物體小動物體 內發光光源的精確位置信息。目前, BLT的光源定位和生物組織光學特性參數的反演問題 已經成為國內外在體生物光學成像研究的重點和難點之一, 但還限于于實驗室研究階段, 沒有達到臨床實驗的階段, 所 以尚未有成熟的成像系統。

在體光纖成像記錄的優點可以非侵入性，實時連續動態監測體內的各種生物學過程，從而可以減少實驗動物數量，及降低個體間差異的影響；由于背景噪聲低，所以具有較高的敏感性；不需要外源性激發光，避免對體內正常細胞造成損傷，有利于長期觀察；此外還有無放射性等其他優點。然而生物發光也有自身的不足之處：例如波長依賴性的組織穿透能力，光在哺乳動物組織內傳播時會被散射和吸收，光子遇到細胞膜和細胞質時會發生折射，而且不同類型的細胞和組織吸收光子的特性也不盡相同，其中血紅蛋白是吸收光子的主要物質；由于是在體外檢測體內發出的信號，因而受到體內發光源位置及深度影響；另外還需要外源性提供各種熒光素酶的底物，且底物在體內的分布與藥動力學也會影響信號的產生；由于熒光素酶催化的生化反應需要氧氣、鎂離子及 ATP 等物質的參與，受到體內環境狀態的影響。在體光纖成像記錄和散射介質成像的機理既有關聯。

在體監測基因療于中的基因表達，隨著 后基因組時代的到來和人們對疾病發生的發展機制的深入了解, 在基因水平上療于壞掉的、 心血管疾病、 和分子遺傳病等惡性疾病已經得到國內外研究人員越來越 較多的關注。如何客觀地檢測基因療于的臨床療效判斷終點, 有效監測轉基因在生物體內的傳送, 并定量檢測基因療于的轉基因表達, 己經成為 基因療于應用的關鍵所在 。通過熒光素酶或綠色熒光蛋白等報告基因, 在體光纖成像記錄能夠進行基因表達的準確定位和定量分析, 在整體水平上無創、 實時、 定量地檢測轉基因的時空表達。有關生命活動的小分子在體光纖成像記錄等都可以被標記。福州在體實時監測光纖記錄

在體生物發光成像不需要外部光源激發。南京神經元成像光纖網站

在體光纖成像記錄和傳統的體外成像或細胞培養相比有著明顯優點。首先，在體光纖成像記錄能夠反映細胞或基因表達的空間和時間分布，從而了解活的物體動物體內的相關生物學過程、特異性基因功能和相互作用。由于可以對同一個研究個體進行長時間反復查看成像，既可以進步數據的可比性，避免個體差異對試驗結果的可影響，又不需要殺死模式動物，節省了大筆科研用度。第三，尤其在藥物開發方面，在體光纖成像記錄更是具有劃時代的意義。根據統計結果，由于進進臨床研究的藥物中大部分由于安全題目而終止，導致了在臨床研究中大量的資金浪費。南京神經元成像光纖網站