CoIP-Mass和CoIP-WB優劣勢:優勢:高通量獲得目的蛋白的專屬蛋白互作庫。劣勢:CoIP的蛋白庫魚龍混雜,包含目的蛋白的直接/間接互作蛋白,非特異結合,殘留蛋白。常規理想IP-Mass項目可鑒定到1000-2000個蛋白,其中絕大部分是非特異性結合及清洗殘留的背景蛋白,導致CoIP-Mass假陽性高,CoIP-WB驗證成功率低,導致研發進展反復跌宕,時間和經費成本占用較大,嚴重影響士氣。其次,項目受限于蛋白表達量和IP抗體有效性,達到理想狀態的CoIP-Mass較難,同時分析門檻較高。因此,該項目成功實施,比較依賴成熟和有分析經驗的團隊。建議整包交給專業的服務商開展檢測。IP-Mass實驗流程:樣品制備、免疫沉淀、洗脫、蛋白酶消化、質譜分析、數據分析,鑒定互作蛋白!四川互作機制CoIP WB檢測
免疫共沉淀CoIP實驗,細胞的收集及裂解方法如下:
收集2E7個細胞樣品,加入PBS洗滌細胞,離心后棄上清收集細胞沉淀。
準備500μl預冷的CellLysisBuffer,分別加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF,混勻后加進細胞沉淀中吹打均勻,冰上孵育30min,期間渦旋混勻幾次。
4℃,12000rpm離心10min,取上清,進行蛋白濃度測定及后續實驗。廣州基云生物,在IP互作組檢測和關鍵機制分子篩選驗證領域,具有豐富的經驗,助力您的互作機制研究,歡迎垂詢合作。 四川互作機制CoIP WB檢測CoIP實驗內源檢測與外源檢測的優缺點。
免疫共沉淀也存在一些局限性。例如,它可能無法檢測到低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質相互作用。此外,兩種蛋白質的結合可能不是直接結合,而可能有第三者在中間起橋梁作用。此外,實驗前需要預測目的蛋白以選擇相應的抗體,因此,如果預測不正確,實驗可能無法得到結果,這使得這種方法具有一定的冒險性。總的來說,免疫共沉淀是一種強大的技術,它能夠為我們提供關于蛋白質相互作用的寶貴信息。然而,為了得到準確和可靠的結果,我們需要謹慎地解釋和分析實驗數據,并考慮到這種方法的局限性。
CoIP實驗Western檢測目的蛋白方法如下:
配膠。
上樣,跑電泳,恒壓100min。
轉膜,濕轉250mA恒流轉1-2h。
封閉,將PVDF膜放入5%的脫脂牛奶中,封閉1h。
孵育一抗(PBS稀釋),4℃孵育過夜。
TBST洗膜3次,每次5min。
孵育二抗(TBST稀釋),室溫孵育1h。
TBST洗膜3次,每次5min。
按1:1的比例將ECL發光液均勻滴到膜上
曝光,顯影,定影。
廣州基云生物,在IP互作組檢測和關鍵機制分子篩選驗證領域,具有豐富的經驗和專業的技術,助力您的互作機制研究。 免疫共沉淀法證實蛋白互作,基于抗體專一性,揭示生理性相互作用。
在CoIP(免疫共沉淀)實驗中,技術重復和生物重復設計建議如下:進行多次技術重復(在同一實驗條件下使用不同的樣品或樣品批次)和生物重復(使用來自不同生物或不同實驗條件的樣品),以評估結果的穩定性和可靠性。在設置對照組時,還需要注意以下幾點:對照組的設置應遵循科學原理,并充分考慮實驗的具體需求和目標。確保對照組和實驗組在實驗條件和操作步驟上保持一致,以便進行準確的比較。在分析實驗結果時,應綜合考慮對照組和實驗組的數據,以得出更準確的結論。總之,在CoIP實驗中,通過精心設計和執行對照組實驗,可以提高實驗的準確性和可靠性,從而更準確地評估目標蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用。Co-IP技術廣泛應用于生物醫學、藥物研發、蛋白質組學等領域,助力科研人員探索生命奧秘!互作機制CoIP-mass spectrometry
Co-IP研究蛋白間互作,ChIP研究蛋白與DNA互作,實驗原理各具特色!四川互作機制CoIP WB檢測
Co-IP實驗的內源檢測注意事項如下:首先,確保使用的抗體具有高特異性和親和力,這是內源檢測成功的關鍵。由于細胞內蛋白表達復雜,非特異性結合可能導致實驗結果失真。其次,嚴格控制實驗條件,如細胞裂解和洗滌條件,以避免破壞蛋白質相互作用或引入非特異性蛋白。溫和地釋放細胞內蛋白,保證釋放出的蛋白不被蛋白酶分解,同時實驗過程需保持低溫。此外,注意樣本的采集和處理。樣本應盡快處理,避免蛋白降解,同時防止樣本在運輸過程中溫度過高導致變質。另外,結合其他實驗方法進行驗證,如Western Blot等,以確認Co-IP實驗結果的可靠性。綜上所述,Co-IP實驗的內源檢測需要關注抗體選擇、實驗條件控制、樣本處理以及結果驗證等方面,以確保實驗結果的準確性和可靠性。四川互作機制CoIP WB檢測