在堆肥過程中，除了嗜熱新芽孢桿菌之外，還有多種微生物發揮著重要作用，主要包括：1.纖維素分解菌：這些微生物能夠分解纖維素，將木質纖維素轉化為可被植物吸收利用的形式。它們在堆肥中的作用是將植物材料中的纖維素和半纖維素分解為更簡單的糖，從而促進堆肥的腐熟過程。2.放線菌：放線菌是一類能夠分解木質素的微生物，它們在堆肥中有助于降解植物殘體中的復雜有機物質，如秸稈等，從而加速堆肥的成熟。3.酵母菌和霉菌：在堆肥的初期，酵母菌和霉菌在分解易分解的有機物（如糖類、淀粉等）方面發揮重要作用，它們有助于堆肥初期的升溫和有機物的快速分解。4.好氧細菌：好氧細菌在堆肥的好氧條件下活躍，它們通過分解有機物來獲取能量，同時釋放出熱量，有助于堆肥溫度的升高。5.固氮菌：固氮菌能夠將大氣中的氮氣轉化為植物可利用的氮源，增加堆肥的營養價值。6.低溫和高溫細菌：在堆肥的不同階段，不同類型的細菌會根據溫度的變化而活躍。低溫細菌在堆肥初期活動，而高溫細菌則在堆肥的中后期，當溫度升高時發揮作用。嗜堿鹽紅菌能夠在高鹽堿環境下保持生長活性，其獨特的代謝機制使其能夠通過調節細胞內的離子濃度極端環境。肉桂紫青霉
溫泉水桿狀菌（Aquifexpyrophilus）是一種嗜熱的細菌，通常在溫泉這類高溫環境中被發現。以下是它們在生物修復中的一些具體應用：1.有機污染物的降解：溫泉水桿狀菌能夠降解有機污染物，如在騰沖溫泉中分離出的Anoxybacillussp.YIM342，能產生一種新穎的α-淀粉酶，這種酶在生物燃料、洗滌劑及食品工業中具有潛在的應用價值。2.砷的生物轉化：從騰沖熱海地熱區SRBZ溫泉水樣中分離出的AnoxybacillusflavithermusTCC9-4，能產生AsIII氧化酶，在化學自養條件下，能氧化90%以上的100mg/LAsIII，這表明溫泉中的微生物可能參與了硫砷酸鹽的形成，為硫砷酸鹽在陸地地熱環境中的分布提供了一種可能的解釋。3.硫循環的參與：在騰沖地熱地區的大滾鍋2號溫泉中分離得到的脫硫腸狀菌屬菌株Desulfotomaculumsp.TC-1，其基因組成功擴增出編碼厭氧亞砷酸氧化酶的arxA基因，表明嗜熱微生物可能參與了硫砷酸鹽的形成。4.微生物介導的砷氧化反應：AnoxybacillusflavithermusTCC9-4的研究拓展了目前對于微生物介導的砷氧化反應的理解，這對于砷污染的環境修復具有重要意義。石泉鹽單胞菌東邊纖細芽孢桿菌在農業、生物技術等領域的應用價值已逐漸顯現。在農業中可以作為生物肥料促進植物生長。
海洋新鞘氨醇菌（Novosphingobiumsp.）是一類在海洋環境中發現的細菌，它們具有一些獨特的特性和功能：1.形態特征：海洋新鞘氨醇菌是革蘭氏陰性菌，不形成孢子，通常通過單側生極性鞭毛運動，多呈現黃色，是專性需氧的細菌，并且能夠產生過氧化氫酶。它們能夠將戊糖、己糖及二糖轉變成酸，除了菊粉外。2.主要價值：海洋新鞘氨醇菌的主要用途包括分類學研究、科學研究和教學。3.環境適應性：海洋新鞘氨醇菌能夠適應海洋環境，尤其是在降解環境中的17β-雌二醇（E2）方面表現出適應性反應和代謝策略。它們在上游降解過程中將E2轉化為雌酮（E1），然后轉化為4-羥基雌酮（4-OH-E1），氧化形成具有長鏈結構的代謝物。這些代謝物通過β-氧化模式進行分解，進入三羧酸（TCA）循環。4.生物降解能力：海洋新鞘氨醇菌能夠降解多種多環芳烴（PAHs），這是一類重要的環境污染物。它們能夠以菲為碳源和能源，高效降解多種高分子量PAHs。通過16SrDNA序列分析，表明它們可能屬于新鞘氨醇桿菌屬（Novosphingobiumsp.），并且具有特定的PAHs降解基因。
帶小棒鏈霉菌的發酵工藝優化是一場“精心的釀造藝術”。在發酵過程中，培養基的成分和配比至關重要，通過合理調整碳源、氮源、礦物質和維生素等營養成分的比例，可以顯著提高其生長速度和代謝產物的產量。例如，采用特定的復合碳源能夠延長帶小棒鏈霉菌的對數生長期，增加生物量積累。發酵條件的控制也不容忽視，溫度、pH值、溶氧等參數需要精確調控。適宜的溫度能夠保證酶的活性和細胞的正常代謝，pH值的穩定有助于維持細胞內環境的平衡，充足的溶氧則滿足其好氧生長的需求。此外，發酵過程中的攪拌速度和通氣量也會影響菌體的分散和氧氣的傳遞效率。通過不斷優化發酵工藝，可以實現帶小棒鏈霉菌的高效培養和次生代謝產物的大規模生產，為其工業化應用提供技術支持，推動生物技術產業的發展。廣布鹽紅菌的菌紅素合成能力使其在生物技術領域具有重要應用價值通過基因工程技術可以提高菌紅素的產量。
大腸桿菌DH5α生長繁殖迅速，恰似微觀世界里的“快速增殖機器”。在適宜的溫度、營養條件下，其細胞分裂周期短，能夠快速增加數量。豐富的營養攝取機制使其高效吸收培養基中的碳源、氮源等物質，代謝途徑流暢，能量供應充足，為細胞快速生長提供動力。在實驗室培養時，短時間內就能獲得大量菌體，滿足各種實驗需求，如大規模制備重組蛋白，快速擴增含目的基因的質粒等，提高實驗效率，縮短研究周期，在生物技術產業的發酵生產環節也具有重要應用價值，降低生產成本，提升生產效益。米氏需鹽桿菌具有較強的有機物降解能力，能夠分解含鹽有機廢物，表現出良好的生物修復潛力。刺孢吸水鏈霉菌北京變種
東邊纖細芽孢桿菌表現出良好的活性，能夠有效對抗一些植物病原菌因此在生物農藥的研發中具有重要價值。肉桂紫青霉
鹽冷彎曲菌（Psychroflexussalinarum）是一種耐鹽的革蘭氏陰性菌，屬于Psychroflexus屬。這種細菌在高鹽度的環境中，如鹽湖、鹽礦和鹽漬土壤中生存和繁殖。以下是鹽冷彎曲菌的一些主要特點：1.形態特征：鹽冷彎曲菌是革蘭氏陰性菌，嚴格異養，好氧。在MA培養基上生長4天后，可以形成1.0-2.5mm的橙紅色，光滑的菌落。2.極端鹽耐性：鹽冷彎曲菌能夠在高鹽濃度的環境中生存，這是它們的特征之一。它們可以適應高達25%NaCl的鹽濃度，這種能力使得它們在極端環境中具有獨特的生態位。3.產生色素：一些鹽冷彎曲菌能夠產生特殊的色素，如類胡蘿卜素類色素，以抵抗紫外線輻射和氧化應激。4.光合作用：盡管鹽冷彎曲菌不是光合細菌，但它們在紫外線光下能夠利用葉綠素產生能量，這與植物和其他光合生物的光合作用有所不同。5.生態學角色：鹽冷彎曲菌在鹽湖和鹽漬土壤等高鹽度環境中起著重要的生態學角色。它們參與了元素循環、有機物降解和食物鏈中的能量流動。6.分子生物學研究：鹽冷彎曲菌的基因組已被測序和研究，以揭示其特殊的適應性基因和代謝途徑。肉桂紫青霉