PNGaseF(肽-N-糖苷酶F)是一種普遍使用的酶,它可以從N-連接糖蛋白中去除幾乎所有類型的N-連接糖鏈。其活性和穩定性可能會在不同的pH條件下發生變化。根據NEB(NewEnglandBiolabs)提供的PNGaseF產品信息,PNGaseF的好的活性和穩定性pH為7.5。在pH7.5時,PNGaseF的活性可以達到100%。然而,酶在不同溫度下的活性表現也有所不同:在37°C時活性為100%,在30°C時也保持100%,而在23°C時活性下降到65%,17°C時為40%,在3°C時幾乎無活性。這表明PNGaseF的活性隨溫度降低而下降,盡管pH值對酶活性有重要影響,但溫度也同樣是一個重要因素。此外,PNGaseF的活性會受到SDS的抑制,因此在變性條件下進行酶切時,反應混合物中必須包含NP-40,以1:1的比例存在,以抵消SDS的抑制作用。對于非變性條件下的酶切,可能需要更多的酶和更長的孵育時間。在實驗操作中,為了確保PNGaseF的好的活性,建議按照制造商提供的推薦緩沖液和條件進行實驗。如果需要在不同的pH條件下使用PNGaseF,可能需要通過實驗優化來確定好的條件。
EndoS,即糖苷內切酶S(Endo-S),是一種具有高度特異性的酶,它在生物化學研究中有著重要應用,尤其是在糖蛋白和抗體藥物偶聯物(ADCs)的研究中。以下是EndoS的一些關鍵特點:1.**特異性**:EndoS能夠特異性地識別并切割N-連接糖鏈的殼二糖結構,即在N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)和天冬酰胺之間的連接處進行切割。2.**應用**:在制備糖鏈定點ADC化合物中,EndoS被用于將小分子細胞毒藥物“一步”定點連接到抗體糖基化位點,提供了一種重要的技術方法。3.**兼容性**:EndoS對多樣化的LacNAc修飾顯示出良好的兼容性,可以接受不同生物正交基團、熒光基團等衍生物作為底物,實現抗體糖基化修飾。4.**活性**:EndoS的活性對多肽沒有嚴格的要求,可以接受蛋白質、肽、天門冬酰胺或游離聚糖作為底物。但是,對于具有三、四個支鏈的唾液酸化及去唾液酸化的聚糖,EndoS沒有活性。5.**產品形式**:EndoS通常以帶有His標簽的形式存在,便于從反應中去除,這在實驗操作中提供了便利。6.**研究進展**:EndoS在去糖基化方法研究中是一個重要的工具,特別是在研究糖蛋白的多肽部分和多糖部分的結構和功能時。
酵母重組表達的PNGaseF(N-糖苷酶F)是一種用于蛋白質去糖基化實驗的酰胺水解酶,具有以下特點以確保實驗中的活性和穩定性:1.**高效性**:具有高比活性,例如750000U/mL,這有助于快速高效地進行去糖基化反應。2.**穩定性**:在含有50%甘油的儲存緩沖液中,比較好的活性和穩定性可維持長達24個月。3.**使用條件**:可以在原生或變性條件下使用,對于變性條件下的去糖基化,建議添加NP-40以解除SDS的抑制作用。4.**儲存條件**:建議在-15~-25℃保存,有效期1年。5.**酶活定義**:1個酶活力單位指在10μL的反應體系中,37℃條件下1小時從10μg變性RNaseB中除去超過95%的碳水化合物所需要的酶量。6.**操作簡便**:提供了使用說明,包括變性和非變性條件下的蛋白質去糖基化步驟。7.**His標簽**:產品帶有His標簽,便于在實驗中進行純化和檢測。8.**純度**:純度達到95%以上,通過SDS-PAGE和完整ESI-MS進行確定。9.**快速反應**:有些產品如FastPNGaseF,可以在數分鐘內完成徹底且無偏好性地去糖基化。10.**注意事項**:產品供科研使用,操作時應穿戴適當的實驗室防護裝備。遵循這些指導原則和產品說明,可以確保PNGaseF在實驗中的活性和穩定性,從而獲得可靠的去糖基化結果。
高保真Cas9變體在實際應用中的優勢主要體現在以下幾個方面:1.**降低脫靶效應**:高保真Cas9變體通過減少與非目標DNA序列的結合,從而降低了基因編輯過程中的脫靶風險。這對于減少基因編輯可能帶來的非預期效果至關重要。2.**提高特異性**:通過工程化改造,如SpCas9-HF1、eSpCas9和HypaCas9等變體,通過在DNA相互作用位點引入突變,減少了對目標DNA的非特異性識別和切割。3.**擴展PAM序列兼容性**:一些高保真Cas9變體,如xCas93.7,能夠識別多種PAM序列,從而擴展了可編輯基因組區域的范圍。4.**提高效果**:在臨床中,高保真Cas9變體可以減少由于脫靶效應引起的潛在風險,提高基因的安全性和有效性。然而,高保真Cas9變體也存在一些局限性:1.**編輯效率可能降低**:在提高特異性的同時,可能會有一定的編輯效率。一些高保真變體可能在保持特異性的同時,編輯效率有所下降。2.**結構和功能復雜性**:高保真Cas9變體的結構改造可能增加其結構和功能的復雜性,這可能對實際應用中的穩定性和可預測性帶來挑戰。3.**成本和可用性**:開發和生產高保真Cas9變體可能需要更多的研究和資源投入,這可能影響其在某些應用中的成本效益。Cas12a同源物能夠識別更簡單的PAM序列(如5-TTN),這使得基因組的覆蓋率顯著提高。
EndoS糖苷內切酶在ADCs制備中的具體應用步驟,根據上海藥物研究所的研究,可以概括為以下幾個關鍵環節:1.**篩選糖底物和糖苷內切酶**:研究人員篩選了一系列糖底物和糖苷內切酶,發現Endo-S2酶能夠將二糖底物LacNAc轉移至去糖抗體N297位糖基化位點,且LacNAc半乳糖6號位唾液酸化修飾不影響Endo-S2的轉糖基化活性。2.**抗體糖基化改造**:利用Endo-S2和LacNAc的組合,直接實現野生型抗體的糖基化改造。Endo-S2對多樣化LacNAc修飾的兼容性,可以高效獲得功能修飾的糖工程抗體。3.**設計合成藥物-連接子復合物**:研究人員設計并合成了LacNAc-linker-drug復合物結構,這是實現定點ADC化合物“一步”組裝的關鍵。4.**“一步”定點偶聯**:通過Endo-S2的催化作用,將小分子細胞毒藥物通過特定的糖鏈結構直接定點連接到抗體的糖基化位點,簡化了ADCs的制備流程。5.**評價和測試**:對獲得的糖鏈定點ADC化合物進行結構均一性、親水性、體外穩定性及體外活性的測試。測試結果顯示,這些化合物具有非常好的結構均一性(DAR=2)、親水性和體外穩定性,并且在體外具有強大的瘤抑制活性。
CRISPR/Cas12a 是一種單一的RNA引導的核酸內切酶,通過CRISPR/Cas9系統為靶向基因組工程提供了新的機會。Recombinant Mouse MCP-2/CCL8
EndoH糖苷內切酶H在實驗中的特異性和效率通常通過以下幾個方面來確定:1.**特異性識別**:EndoH能夠特異性地識別并切割高甘露糖型N-連接糖鏈,這些糖鏈通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**切割位點**:EndoH識別并切割殼二糖結構中的β-1,4-糖苷鍵連接的甘露糖型結構糖鏈,但不能切割復雜型糖鏈糖蛋白。3.**酶活性測試**:通過使用標準糖蛋白底物進行酶活性測試,可以確定EndoH的活性和效率。4.**純化效果**:EndoH的純度可大于95%,這有助于確保實驗中酶的高效性。5.**比較分析**:與其他去糖基化酶(如PNGaseF)進行比較分析,可以評估EndoH的特異性和效率。6.**應用效果**:EndoH用于基于DNA測序的熒光輔助糖電泳(DSA-FACE)分析核糖核酸酶B(ribonucleaseB,RNaseB)的糖基結構,可以比較不同酶的糖基切割功能。7.**酶切時間**:EndoH的酶切時間通常為1-3小時,這有助于評估酶的效率。8.**產品信息**:通過查看產品信息,包括產品編號、規格和目錄價,可以了解EndoH的商業可用性和應用范圍。通過這些方法,研究人員可以確保EndoH在糖鏈分析中的特異性和效率,從而獲得準確的糖鏈結構信息。Recombinant Mouse MCP-2/CCL8