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除了CRISPR-Cas9技術,還有其他幾種基因編輯技術可以用于金黃色葡萄球菌的研究:1.**單堿基編輯技術**:這是一種新型的基因編輯技術,可以在不切割DNA雙鏈的情況下實現(xiàn)基因的定點突變。季泉江教授課題組與中國科學院北京基因組所韓大力研究員課題組合作,在金黃色葡萄球菌中建立了單堿基編輯技術,通過融合失活的Cas9蛋白(Cas9D10A)和胞嘧啶脫氨酶(APOBEC1),實現(xiàn)了高效單堿基編輯,有助于研究耐藥機制和開發(fā)新型手段。2.**同源重組(HR)修復技術**:在某些細菌中,可以通過同源重組機制對CRISPR-Cas9系統(tǒng)產(chǎn)生的雙鏈DNA斷裂進行修復,實現(xiàn)基因的精確編輯。例如,在谷氨酸棒桿菌中,利用CRISPR/Cas9技術結合同源重組修復模板,實現(xiàn)了高效的基因缺失和點突變。3.**非同源末端連接(NHEJ)相關蛋白共表達**:通過共表達Cas9蛋白和NHEJ相關蛋白,如連接酶LigD,可以在鏈霉菌中實現(xiàn)有效的基因組編輯,這種方法不依賴于同源重組,可以應用于那些同源重組效率較低的細菌。4.**CRISPR干擾技術(CRISPRi)**:利用失活的Cas9蛋白(dCas9)阻斷基因的轉(zhuǎn)錄,從而抑制特定基因的表達。這種技術可以用于研究基因功能和調(diào)控基因表達,已經(jīng)在多種細菌中得到應用。利用基因編輯技術對粘質(zhì)沙雷氏菌進行精細基因調(diào)控,拓展其應用領域。福建重組蛋白表達服務技術服務研發(fā)
重組蛋白表達服務是生物技術領域的一個重要分支,它涉及到使用各種生物表達系統(tǒng)來生產(chǎn)特定的重組蛋白,這些蛋白通常用于臨床前研究、藥物開發(fā)、疫苗制備等。以下是重組蛋白表達服務在臨床前研究中的一些關鍵應用和技術要點:1.**目標蛋白的選擇與設計**:-根據(jù)研究目的選擇合適的目標蛋白,可能包括蛋白、酶、抗體、病毒抗原等。-設計蛋白序列時,可能需要進行突變、融合標簽或優(yōu)化密碼子以提高表達效率。2.**表達系統(tǒng)的選取**:-選擇適合目標蛋白的表達系統(tǒng),如大腸桿菌、酵母、昆蟲細胞、哺乳動物細胞等,每個系統(tǒng)都有其特定優(yōu)勢和局限性。3.**載體構建**:-構建含有目標蛋白基因的表達載體,選擇合適的啟動子、標記基因和抗性基因。4.**蛋白表達與優(yōu)化**:-將構建好的載體轉(zhuǎn)化到宿主細胞中,進行蛋白表達。-通過優(yōu)化誘導條件、培養(yǎng)時間和溫度等參數(shù)來提高蛋白的表達量和可溶性。5.**翻譯后修飾**:-根據(jù)蛋白的功能需求,進行必要的翻譯后修飾,如磷酸化、糖基化等。6.**蛋白純化**:-使用色譜等技術對表達的蛋白進行純化,確保蛋白的純度和活性。7.**功能性驗證**:-對純化后的蛋白進行功能性驗證,確保其生物學活性和穩(wěn)定性。重組蛋白表達服務技術服務開發(fā)基因編輯技術還可以用于大腸桿菌的基因組工程。
酵母表達高通量篩選技術在藥物發(fā)現(xiàn)中相比其他表達系統(tǒng)具有一些獨特的優(yōu)勢和局限性。**優(yōu)勢:**1.**真核表達系統(tǒng)**:酵母作為真核生物,能夠進行復雜的蛋白質(zhì)折疊和翻譯后修飾,如糖基化,這使得其表達的蛋白質(zhì)更接近天然形式,有助于藥物的活性和穩(wěn)定性。2.**高通量篩選能力**:通過液滴微流控技術,可以實現(xiàn)單細胞水平的高通量篩選,快速從大量突變體中篩選出表達量高的菌株,提高篩選效率。3.**成本效益**:與傳統(tǒng)的微孔板篩選方法相比,液滴微流控篩選技術可以降低試劑成本,實現(xiàn)更經(jīng)濟的篩選過程。4.**易于操作和培養(yǎng)**:酵母細胞易于在實驗室條件下培養(yǎng),且培養(yǎng)條件相對簡單,有助于藥物發(fā)現(xiàn)過程中的規(guī)模化生產(chǎn)。**局限性:**1.**表達量問題**:盡管酵母系統(tǒng)在表達外源蛋白方面具有優(yōu)勢,但對于一些蛋白質(zhì),其表達量可能仍然低于某些原核系統(tǒng),如大腸桿菌。2.**遺傳操作復雜性**:與原核生物相比,酵母的遺傳操作更為復雜,可能需要更多的時間和技巧來進行基因編輯和表達載體的構建。3.**糖基化模式差異**:酵母的糖基化模式與哺乳動物細胞存在差異,這可能影響蛋白質(zhì)的生物學功能和免疫原性,對于某些藥物開發(fā)來說可能是一個挑戰(zhàn)。
通過畢赤酵母表達系統(tǒng)提高重組蛋白的表達量和純度,可以采取以下策略:1.**優(yōu)化基因序列**:根據(jù)畢赤酵母的密碼子偏好性進行基因序列的優(yōu)化,避免含有畢赤酵母稀有的密碼子,減少(A+T)含量過高或過低的問題。2.**增加基因拷貝數(shù)**:通過體外構建或體內(nèi)構建法增加外源基因的拷貝數(shù),可以提高蛋白的表達量。3.**選擇合適的啟動子**:使用強誘導型啟動子如AOX1或組成型啟動子,以提高基因的轉(zhuǎn)錄水平。4.**使用分子伴侶**:共表達分子伴侶如PDI或BiP,幫助目標蛋白正確折疊,減少聚集體的形成。5.**選擇合適的信號肽**:使用合適的信號肽引導重組蛋白分泌到胞外,如α-因子信號肽(MF-α)等。6.**優(yōu)化培養(yǎng)條件**:調(diào)整溫度、pH、碳源、甲醇濃度等培養(yǎng)條件,以獲得好的蛋白表達效果。7.**發(fā)酵工藝優(yōu)化**:采用高密度發(fā)酵,優(yōu)化溶解氧水平、通氣量等,提高蛋白表達量。8.**減少蛋白酶活性**:通過降低發(fā)酵液pH、添加蛋白酶底物或敲除蛋白酶基因等方法,減少蛋白降解。9.**提高分泌效率**:通過改造信號肽或共表達轉(zhuǎn)運相關因子,提高外源蛋白分泌效率。研究人員成功編輯粘質(zhì)沙雷氏菌基因,為開發(fā)新型生物材料提供了有力支持。
除了His標簽和GST標簽,還有多種融合伴侶技術可以用于提高蛋白的表達和純度,包括但不限于以下幾種:1.**Flag標簽**:Flag是一個八肽序列(DYKDDDDK),可以通過抗Flag標簽的抗體進行免疫沉淀或西方印跡分析,有助于提高蛋白的純度。2.**Fc融合蛋白**:Fc標簽是免疫球蛋白的恒定區(qū),可以提高蛋白在哺乳動物細胞中的溶解性和穩(wěn)定性,并且可以通過蛋白A親和層析進行純化。3.**人血清白蛋白(HSA)**:HSA作為融合伴侶可以提高蛋白的溶解性和穩(wěn)定性,延長半衰期,并通過其固有的結合特性進行純化。4.**轉(zhuǎn)鐵蛋白**:轉(zhuǎn)鐵蛋白可以作為融合伴侶,利用其與鐵的高親和力進行純化,并且有助于提高蛋白的穩(wěn)定性。5.**XTEN聚合物**:XTEN是一種柔性的多肽聚合物,可以提高蛋白的溶解性和穩(wěn)定性,有助于防止聚集。6.**彈性蛋白樣多肽(ELP)**:ELP具有可逆的熱響應性質(zhì),可以通過溫度誘導的相分離進行純化,有助于提高純度。7.**Strep標簽**:Strep標簽是一個短肽序列,可以通過Strep-Tactin親和層析進行高效率的純化。8.**MBP融合蛋白**:麥芽糖結合蛋白(MBP)可以作為融合伴侶,提高蛋白的溶解性,并通過親和層析進行純化。。根據(jù)Addgene、MolecularCloud以及實驗室自行寄出的數(shù)據(jù)顯示,pCas已被使用723次,pTargetF已被使用615次。江蘇CHO細胞穩(wěn)定表達技術服務臨床前研究
基因編輯技術可以用來優(yōu)化大腸桿菌的表達系統(tǒng),提高重組蛋白的產(chǎn)量和純度。福建重組蛋白表達服務技術服務研發(fā)
10×MOPSRNA緩沖液是一種常用于RNA電泳的試劑,以下是使用10×MOPSRNA緩沖液進行RNA電泳的步驟:1.**準備凝膠**:-將瓊脂糖粉末與10×MOPSRNA緩沖液混合,比例通常為1%至2%的瓊脂糖溶液。例如,對于1%的瓊脂糖凝膠,取1克瓊脂糖粉末加入100毫升的1×MOPS緩沖液中。-加熱混合溶液至瓊脂糖完全溶解。2.**稀釋緩沖液**:-將10×MOPSRNA緩沖液用DEPC處理的超純水或無菌水稀釋至1×工作濃度。例如,取100毫升的10×MOPSRNA緩沖液,加入900毫升的DEPC水,充分混勻。3.**制備凝膠板**:-將溶解好的瓊脂糖溶液倒入凝膠模具中,插入梳子以形成樣品孔。-待凝膠凝固后,取出梳子,準備上樣。4.**樣品準備**:-將RNA樣品與適當?shù)纳蠘泳彌_液(如甲醛上樣緩沖液)混合,通常按1:1的比例。-如果需要,可以在65-70℃下加熱樣品5-10分鐘進行變性處理。5.**裝載電泳槽**:-將制備好的1×MOPSRNA緩沖液倒入電泳槽的兩個槽中,確保凝膠板被緩沖液完全浸沒。6.**上樣**:-加載RNA樣品到凝膠孔中。通常使用微量移液器進行操作,確保樣品完全進入孔中。果。福建重組蛋白表達服務技術服務研發(fā)