ChIP-seq與ChIP-qPCR在實(shí)驗(yàn)原理和應(yīng)用方面存在一些相同點(diǎn)。首先，它們的實(shí)驗(yàn)原理都基于染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP），這是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。它們都通過(guò)特異性抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)結(jié)合，形成免疫復(fù)合物，從而富集與特定蛋白質(zhì)結(jié)合的DN**...

免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)步驟主要包括以下五個(gè)部分：樣品處理：將細(xì)胞或組織樣品進(jìn)行裂解，得到待檢測(cè)的蛋白質(zhì)混合物，并加入蛋白酶抑制劑以避免目標(biāo)蛋白被降解。抗體處理：將專一的抗體連接到親和樹(shù)脂上，如蛋白A的親和樹(shù)脂或蛋白G的親和樹(shù)脂，或?qū)⒌鞍着c其特異性抗體結(jié)合，新形成的復(fù)合...

真核生物的基因組DNA以染色質(zhì)的形式存在。因此，研究蛋白質(zhì)與DNA在染色質(zhì)環(huán)境下的相互作用是闡明真核生物基因表達(dá)機(jī)制的基本途徑。染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目研究體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相...

在蛋白質(zhì)組學(xué)研究的浩瀚海洋中，CDILabs的HuProt?人類蛋白質(zhì)組微陣列技術(shù)如同璀璨的燈塔，照亮了前行的道路。這項(xiàng)技術(shù)以其覆蓋人類蛋白質(zhì)組的優(yōu)勢(shì)，為研究者們提供了新的洞察力，使他們能夠以前所未有的深度和廣度探索蛋白質(zhì)的功能與相互作用機(jī)制。HuProt?技...

IP-Mass（免疫沉淀-質(zhì)譜）實(shí)驗(yàn)流程主要包括以下步驟：樣品制備：收集細(xì)胞或組織樣品，并進(jìn)行適當(dāng)?shù)牧呀馓幚?，以釋放?xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。免疫沉淀：將特異性抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合，形成抗原-抗體復(fù)合物。隨后，將復(fù)合物與固相載體（如磁珠）結(jié)合，通過(guò)洗滌步驟去除非特異性結(jié)合...

在蛋白組芯片的制備流程中，蛋白組蛋白的表達(dá)制備無(wú)疑是關(guān)鍵的起始步驟。這一步驟的成功與否，直接關(guān)系到后續(xù)芯片制備的順利進(jìn)行以及芯片的質(zhì)量與性能?？蒲腥藛T首先需精心挑選目標(biāo)基因，并巧妙地將其克隆至適合的表達(dá)載體中。這一過(guò)程中，科研人員需要利用一系列復(fù)雜的分子生物學(xué)...

ChIP技術(shù)，即染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)，是一種研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有效手段。其基本原理在于，利用特異性抗體與目的蛋白結(jié)合，通過(guò)一系列復(fù)雜的生化操作，將與之結(jié)合的DNA片段一同沉淀下來(lái)。這一技術(shù)的關(guān)鍵在于抗體的選擇，只有高度特異性的抗體才能確保捕獲到與目標(biāo)...

在CoIP（免疫共沉淀）實(shí)驗(yàn)中，對(duì)照組的設(shè)計(jì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果尤為重要，陽(yáng)性對(duì)照組設(shè)計(jì)建議如下：1. 已知相互作用蛋白對(duì)照組：如果可能的話，使用已知與誘餌蛋白相互作用的蛋白作為陽(yáng)性對(duì)照。這可以驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)條件的可行性，以及抗體和實(shí)驗(yàn)方法的可靠性。2. 設(shè)置過(guò)量誘餌蛋白對(duì)照...

藥物研發(fā)過(guò)程中，理解藥物與生物分子之間的相互作用至關(guān)重要。ChIP技術(shù)為藥物研發(fā)提供了新的手段。通過(guò)分析藥物對(duì)特定轉(zhuǎn)錄因子或調(diào)控蛋白與DNA相互作用的影響，我們可以預(yù)測(cè)藥物可能的作用機(jī)制和效果。此外，ChIP技術(shù)還可以用于篩選潛在的藥物靶點(diǎn)，為新藥開(kāi)發(fā)提供新的...

2020年，協(xié)和醫(yī)院胡卓偉團(tuán)隊(duì)在國(guó)際知名期刊《NatureCommunication》發(fā)表了關(guān)于肺cancer研究的突破性文章，成功發(fā)現(xiàn)了新型藥物靶點(diǎn)TRIB3。該研究通過(guò)精細(xì)的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)，證明了TRIB3對(duì)EGFR內(nèi)吞循環(huán)穩(wěn)定性的重要影響，為肺cancer的新...

蛋白組芯片技術(shù)在疾病標(biāo)志物篩查領(lǐng)域的作用日益凸顯。該技術(shù)通過(guò)高通量的蛋白質(zhì)檢測(cè)與分析，為患者樣本中的蛋白質(zhì)變化提供了詳盡的剖析，進(jìn)而篩選出與特定疾病緊密相關(guān)的標(biāo)志物。與傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)檢測(cè)方法相比，蛋白組芯片技術(shù)展現(xiàn)出了更高的靈敏度和特異性。它能夠在復(fù)雜的生物樣本...

染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）實(shí)驗(yàn)的優(yōu)點(diǎn)（二）?？赏瑫r(shí)分析多個(gè)位點(diǎn)：ChIP技術(shù)可以同時(shí)分析多個(gè)染色質(zhì)位點(diǎn)上的修飾或蛋白-DNA相互作用，從而提供信息。這有助于研究基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性和蛋白質(zhì)之間的協(xié)同作用。應(yīng)用領(lǐng)域：ChIP技術(shù)可以用于研究基因調(diào)控、表觀遺傳學(xué)、...

蛋白是功能的執(zhí)行者，其中關(guān)鍵蛋白（如分泌蛋白、激酶）通過(guò)與其他蛋白的相互作用網(wǎng)絡(luò)調(diào)控，發(fā)揮了重要的作用。蛋白-蛋白相互作用（Protein-ProteinInteraction,PPI)在信號(hào)傳導(dǎo)、功能調(diào)控等重要生物學(xué)進(jìn)程中起著重要作用，蛋白質(zhì)組學(xué)的重要任務(wù)就...

免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）是一種經(jīng)典的生物學(xué)技術(shù)，主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用。它以其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)在蛋白質(zhì)組學(xué)、生物化學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)等領(lǐng)域中得到了大范圍應(yīng)用。Co-IP的主要優(yōu)點(diǎn)包括。直接性：Co-IP能夠直接檢測(cè)...

轉(zhuǎn)錄因子機(jī)制研究是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程，涉及多個(gè)步驟和技術(shù)。轉(zhuǎn)錄因子機(jī)制研究建議（二）。執(zhí)行實(shí)驗(yàn)：按照實(shí)驗(yàn)計(jì)劃進(jìn)行操作，記錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程和結(jié)果。確保實(shí)驗(yàn)操作的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。數(shù)據(jù)分析：使用適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計(jì)方法和軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和分析。將結(jié)果與已知數(shù)據(jù)進(jìn)行比較，并解釋發(fā)...

綜上所述，HuProt?人類蛋白質(zhì)組微陣列技術(shù)以其高通量的優(yōu)勢(shì)，為蛋白質(zhì)組學(xué)研究領(lǐng)域帶來(lái)了前所未有的變革。它不僅能夠提供豐富的蛋白質(zhì)資源，還支持研究者對(duì)蛋白質(zhì)的功能和相互作用機(jī)制進(jìn)行深入的探索。隨著技術(shù)的不斷發(fā)展和完善，我們有理由相信，HuProt?將在未來(lái)實(shí)...

ChIP-qPCR實(shí)驗(yàn)是一種結(jié)合染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）與實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qPCR）的技術(shù)，具有獨(dú)特的實(shí)驗(yàn)意義和應(yīng)用價(jià)值。首先，ChIP-qPCR實(shí)驗(yàn)可以驗(yàn)證特定轉(zhuǎn)錄因子或其他蛋白質(zhì)與特定DNA序列的結(jié)合情況。這對(duì)于確認(rèn)已知的蛋白質(zhì)-DNA相互作用以及深...

Co-IP（免疫共沉淀）實(shí)驗(yàn)的內(nèi)源檢測(cè)是驗(yàn)證蛋白質(zhì)相互作用的關(guān)鍵步驟。在進(jìn)行Co-IP實(shí)驗(yàn)的內(nèi)源檢測(cè)時(shí)，通常的做法是：樣品制備：首先，需要收集并制備細(xì)胞或組織樣品。確保樣品的新鮮度，避免蛋白降解。裂解細(xì)胞：在適當(dāng)?shù)牧呀鈼l件下，裂解細(xì)胞以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。這一...

Co-IP（免疫共沉淀）實(shí)驗(yàn)操作的要點(diǎn)。1.細(xì)胞裂解：確保采用溫和的裂解條件，以保持細(xì)胞內(nèi)存在的蛋白間相互作用。使用非變性裂解液進(jìn)行裂解和洗滌。2.抗體固定：選擇經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的抗體，以減少假陽(yáng)性結(jié)果。注意抗體與緩沖液的比例，避免抗體稀釋過(guò)度或過(guò)多。3.抗體結(jié)合：將...

ChIP-seq實(shí)驗(yàn)技術(shù)是一種結(jié)合了染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）和高通量測(cè)序（seq）的方法，用于研究細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA的相互作用。這項(xiàng)技術(shù)通過(guò)特異性抗體將目標(biāo)蛋白與其結(jié)合的DNA片段共同沉淀下來(lái)，然后利用高通量測(cè)序技術(shù)分析這些DNA片段，從而揭示蛋白質(zhì)在基因...

Co-IP（免疫共沉淀）實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)眾多，以確保實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性。首先，抗體的選擇至關(guān)重要，必須選擇特異性強(qiáng)的抗體，避免非特異性結(jié)合導(dǎo)致背景噪聲。其次，樣品的處理過(guò)程需要嚴(yán)格控制，確保樣品純度和完整性，減少雜質(zhì)或降解產(chǎn)物對(duì)結(jié)果的影響。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中，操作細(xì)節(jié)也...

在CoIP（免疫共沉淀）實(shí)驗(yàn)中，對(duì)照組的設(shè)計(jì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果尤為重要，陽(yáng)性對(duì)照組設(shè)計(jì)建議如下：1. 已知相互作用蛋白對(duì)照組：如果可能的話，使用已知與誘餌蛋白相互作用的蛋白作為陽(yáng)性對(duì)照。這可以驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)條件的可行性，以及抗體和實(shí)驗(yàn)方法的可靠性。2. 設(shè)置過(guò)量誘餌蛋白對(duì)照...

IP-Mass（免疫沉淀-質(zhì)譜）技術(shù)是一種結(jié)合了免疫沉淀和質(zhì)譜分析的方法，用于研究蛋白質(zhì)相互作用和差異蛋白質(zhì)分析。該技術(shù)首先利用特異性抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合，形成抗原-抗體復(fù)合物。然后，這些復(fù)合物被吸附到固相載體上，經(jīng)過(guò)洗滌步驟去除非特異性結(jié)合的雜質(zhì)。接下來(lái)，蛋白...

在CoIP（免疫共沉淀）實(shí)驗(yàn)中，對(duì)照組的設(shè)計(jì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果尤為重要，陽(yáng)性對(duì)照組設(shè)計(jì)建議如下：1. 已知相互作用蛋白對(duì)照組：如果可能的話，使用已知與誘餌蛋白相互作用的蛋白作為陽(yáng)性對(duì)照。這可以驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)條件的可行性，以及抗體和實(shí)驗(yàn)方法的可靠性。2. 設(shè)置過(guò)量誘餌蛋白對(duì)照...

ChIP實(shí)驗(yàn)關(guān)鍵步驟1）細(xì)胞的準(zhǔn)備及固定細(xì)胞在培養(yǎng)皿上生長(zhǎng)到80%~90%。當(dāng)做實(shí)驗(yàn)時(shí)，可以同時(shí)準(zhǔn)備兩個(gè)培養(yǎng)皿，一個(gè)用于預(yù)測(cè)細(xì)胞數(shù)量（細(xì)胞量為1E5），另外一個(gè)用于優(yōu)化超聲條件。2）染色質(zhì)超聲斷裂加入SDS裂解溶液重懸沉淀，在冰上放置10min,每隔1min顛...

IP-WB（免疫沉淀-Western Blot）技術(shù)的缺點(diǎn)主要包括以下幾個(gè)方面：抗體特異性要求：IP-WB技術(shù)對(duì)抗體的特異性要求極高。如果抗體特異性不強(qiáng)，可能會(huì)導(dǎo)致非特異性結(jié)合，增加背景噪聲，影響結(jié)果的準(zhǔn)確性。低豐度蛋白檢測(cè)難度：由于IP-WB技術(shù)的靈敏度限制...

Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)被廣泛應(yīng)用于生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域，特別是在蛋白質(zhì)相互作用、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、疾病機(jī)制等方面。因此，許多從事這些領(lǐng)域的研究人員都在使用Co-IP技術(shù)。以下人員可能會(huì)使用Co-IP技術(shù)。生物醫(yī)學(xué)研究人員：在研究疾病的發(fā)生機(jī)制、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、蛋白...

ChIP-qPCR和ChIP-seq實(shí)驗(yàn)在多個(gè)方面存在異同點(diǎn)。首先，在實(shí)驗(yàn)流程上，兩者都包含染色質(zhì)免疫沉淀這一關(guān)鍵步驟，用于富集與特定蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA片段。然而，在后續(xù)的檢測(cè)方法上，它們有所不同。ChIP-qPCR采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)這些片段進(jìn)行定量...

染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）實(shí)驗(yàn)的優(yōu)點(diǎn)（一）。高特異性：ChIP技術(shù)可以針對(duì)特定的染色質(zhì)修飾或蛋白進(jìn)行檢測(cè)，具有很高的特異性。通過(guò)使用特異性抗體，可以精確地識(shí)別并沉淀與目的蛋白結(jié)合的染色質(zhì)片段，從而研究該蛋白在基因組上的結(jié)合位點(diǎn)。保存染色質(zhì)結(jié)構(gòu)：ChIP實(shí)驗(yàn)可以...

Q:ChIP-Seq和ChIP-qPCR有何異同？A:染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP）所獲得的DNA產(chǎn)物，在ChIP-Seq中通過(guò)高通量測(cè)序的方法，在全基因組范圍內(nèi)尋找目的蛋白（轉(zhuǎn)錄因子、修飾組蛋白）的DNA結(jié)合位點(diǎn)片段信息；ChIP-qPCR需要預(yù)設(shè)待測(cè)的目...