循環水養殖系統難點是解決氮循環的問題，要消除氨氮和亞硝/酸氮的影響。傳統的解決方案是在循環水養殖系統中加入了反硝化反應池，但由于反硝化作用需要在嚴格厭氧條件下進行，因此硝化作用反應池需要跟反硝化作用反應池分開，這就增加了循環水養殖系統的成本。前循環水養殖設備已實現工廠化生產，實現養殖池與養殖凈化設備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環水養殖系統中，實現養殖水的循環利用。
如果將系統中的過濾砂缸換成全自動滾筒微濾機，系統將實現自動化。 如果客戶當地氣溫適宜，系統可以沒有冷暖機。 優點：1.可達到循環水養殖，養殖密度大，效益高； 2.病疫風險小； 3.水耗小，電耗小； 4.系統設備已集成，免安裝。 5.設計合理，維護方便。該模式集現代工程、機電、生物、環保及飼料等多學科于一體，在相對封閉空間內，利用過濾、曝氣、生物凈化、殺菌消毒等物理、化學及生物手段,處理、去除養殖對象的代謝產物和餌料殘渣，使水質凈化并循環使用，少量補水(5%左右)，進行水產動物高密度強化培育。
主要目的是存水，以期在枯水期能有足夠的水源進行養殖而已。這種方式沒有考慮水體的循環利用，而純粹出于延長養殖周期。在此基礎上，有部分養殖場為了提高生產效率和應對自然條件限制從而開始了半循環養殖方式。生物絮團是養殖水體中以好氧微生物為主體的有機體和無機物，經生物絮凝形成的團聚物，由細菌、浮游動植物、有機碎屑和一些無機物質相互絮凝組成。