很多人會問自來水可以進行水產養殖嗎，答案是否定的。讓我們來先了解一下魚的免疫系統，魚身體的表皮層內長有一種杯狀細胞，不斷地在分泌著粘液，使魚體減少游在水中的摩擦，同時，粘液又能保護魚體不受寄生物、霉菌、細菌和其他微小生物的侵蝕，并使皮膚具有一種正常的滲透能力。為什么說自來水不適合水產養殖呢，因為自來水中主要含有"氯"的成份。自來水中的氯卻是一種強氧化劑，在水中生成很不穩定的強氧化劑---次氯酸。
循環水養殖系統難點是解決氮循環的問題，要消除氨氮和亞硝(xiao)酸氮的影響。環控公司的解決方案是在循環水養殖系統中加入了反硝化反應池，但由于反硝化作用需要在嚴格厭氧條件下進行，因此硝化作用反應池需要跟反硝化作用反應池分開。目前循環水養殖設備已實現工廠化生產，做到了養殖池與養殖凈化設備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環水養殖系統中，實現養殖水的循環利用。
20世紀90年代，在淡水養殖方面，隨著經濟的快速發展，全國各地興建了很多水產養殖示范區，建立了一批淡水魚類工廠化循環水養殖系統，但是其經濟性矛盾依然突出。而工廠化循環水苗種繁殖生產系統具有水環境可控、苗種質量高等優點，適應了苗種生產的反季節性、水質條件要求高的特點，并且苗種的單位產值高，使之得到了一定程度的應用。以大菱鲆工廠化流水養殖為代表的海水工廠化養殖的大力推廣，隨之而來的是優質水資源大量耗用，尤其是地下水資源，造成地下水位下降、地陷等諸多問題?！熬盼濉币詠?，國家有關科研計劃大力支持海水工廠化循環水養殖的研究，并取得了重要的階段性成果。